Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms