Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms