Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp54bE9PXC0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srp54bE9PXC0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms