Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9008E9PVG0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms