Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Vpreb3D3Z6J4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms