Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SafbD3YXK2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms