Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clrn2B2RVW2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms