Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud7bB2RUR8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud7bB2RUR8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms