Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palm3A2TJV2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms