Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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