Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms