Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ambra1A2AH22 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms