Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrit3W8DXL4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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