Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms