Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms