Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms