Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms