Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms