Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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