Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tgm1Q9JLF6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgm1Q9JLF6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms