Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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