Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hmgn5Q9JL35 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms