Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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