Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1Q9JIT0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms