Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms