Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms