Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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