Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Erg28Q9ERY9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Erg28Q9ERY9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms