Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cse1lQ9ERK4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cse1lQ9ERK4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms