Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms