Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rnft1Q9DCN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rnft1Q9DCN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnft1Q9DCN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnft1Q9DCN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rnft1Q9DCN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rnft1Q9DCN7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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