Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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