Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms