Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms