Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms