Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc6Q9D4E6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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