Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2lQ9D478 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2lQ9D478 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms