Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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