Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms