Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms