Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrs1Q9CYH6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrs1Q9CYH6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrs1Q9CYH6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrs1Q9CYH6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrs1Q9CYH6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrs1Q9CYH6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms