Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cnot11Q9CWN7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Cnot11Q9CWN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot11Q9CWN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Cnot11Q9CWN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cnot11Q9CWN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot11Q9CWN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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