Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl3Q9CUS9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms