Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pard3bQ9CSB4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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