Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms