Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdm1Q9CQK3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdm1Q9CQK3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rdm1Q9CQK3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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