Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sar1bQ9CQC9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms