Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms