Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tdrd1Q99MV1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tdrd1Q99MV1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms