Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrapQ99MP8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms